O Centro de Pesquisa do Instituto de Câncer Dr. Arnaldo permite às equipes médicas do hospital a realização de estudos clínicos voltados para análise de eficácia e eficiência dos diagnósticos. As linhas de pesquisa são abrangentes para os tipos de tumores mais prevalentes seguindo as normas da Resolução 466/12 da Comissão Nacional de Ética em Pesquisa (CONEP-CNS/MS).

Seu principal objetivo é avaliar de forma ética todo projeto de pesquisa envolvendo seres humanos, em qualquer área, com possibilidades de riscos à dimensão física, psíquica, moral, intelectual, social, cultural e ou espiritual do sujeito de pesquisa. Além disso, o Comitê de Ética em Pesquisa (CEP) tem caráter educativo orientando os pesquisadores a preencherem de forma ética seus projetos de pesquisa.

O CEP é credenciado junto ao Conselho Nacional de Ética em Pesquisa do Conselho Nacional da Saúde, do Ministério da Saúde (CONEP-CNS/MS) desde 1997, oferecendo aos pesquisadores, instituições e principalmente aos pacientes a garantia de respeito aos preceitos éticos e legais vigentes. Os representantes do Comitê possuem um mandato de três anos.

Todos os projetos de pesquisa a serem realizados no Instituto de Câncer Dr. Arnaldo devem ser submetidos ao CEP, o qual reúne-se mensalmente, sempre nas últimas terças-feiras do mês, para a avaliação dos projetos de pesquisas encaminhadas à Instituição.